Страница 3 семестра

Задание 10

Поиск производился на ENA. В разделе "Titles, aliases and descriptions" было выбранно 2 параметра Description * complete* и * chromosome*. В "Taxonomy and related" я выбрал род Staphylococcus.Итого запрос выглядел так:

tax_tree(1279) AND description="* complete*" AND description="* chromosome*"

Я выбрал геномы 2-х штаммов Staphylococcus epidermidis DAR1907 и FDAARGOS_153.

Рис.1 алгоритм megablast. По оси абцис штамм FDAARGOS_153 , по оси ординат DAR1907.

Рис.2 алгоритм blastn. По оси абцис штамм FDAARGOS_153 , по оси ординат DAR1907.